Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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