Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf518bB2RRE4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms