Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uhrf1bp1B2KF50 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms