Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms