Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms