Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms