Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms