Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd6ipQ9WU78 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pdcd6ipQ9WU78 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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