Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms