Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fhl3Q9R059 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms