Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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