Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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