Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hacd1Q9QY80 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms