Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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