Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms