Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim44Q9QXA7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim44Q9QXA7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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