Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms