Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Crlf1Q9JM58 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Crlf1Q9JM58 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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