Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pole3Q9JKP7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pole3Q9JKP7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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