Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ybx3Q9JKB3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms