Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms