Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms