Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tlr1Q9EPQ1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms