Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms