Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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