Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms