Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs6Q9D6W8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms