Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms