Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms