Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem39aQ9CYC3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms