Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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