Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms