Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med4Q9CQA5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms