Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms