Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms