Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tdrd1Q99MV1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms