Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PtprtQ99M80 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PtprtQ99M80 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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