Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ctu1Q99J10 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ctu1Q99J10 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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