Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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