Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf13Q8K2W6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms