Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FgbQ8K0E8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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