Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma3Q8JZW8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma3Q8JZW8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms