Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf17Q8CFA7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf17Q8CFA7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf17Q8CFA7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms