Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc27Q8CD92 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms