Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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