Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms