Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik4Q8BMF5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms