Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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