Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem39bQ810L4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms