Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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